Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb5Q02739 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb5Q02739 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms