Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pax5Q02650 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms