Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Htr1fQ02284 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms