Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1cQ01815 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms