Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms