Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms