Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms