Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps3aP97351 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps3aP97351 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps3aP97351 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps3aP97351 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps3aP97351 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps3aP97351 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms