Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms