Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx3P81067 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx3P81067 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx3P81067 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx3P81067 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx3P81067 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx3P81067 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx3P81067 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Irx3P81067 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Irx3P81067 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Irx3P81067 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Irx3P81067 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx3P81067 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx3P81067 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx3P81067 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx3P81067 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx3P81067 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx3P81067 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Irx3P81067 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx3P81067 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Irx3P81067 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx3P81067 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx3P81067 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx3P81067 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms