Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx2P81066 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx2P81066 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx2P81066 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx2P81066 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx2P81066 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms