Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CiitaP79621 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CiitaP79621 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiitaP79621 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiitaP79621 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiitaP79621 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiitaP79621 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CiitaP79621 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CiitaP79621 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CiitaP79621 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms