Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx3P70354 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx3P70354 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx3P70354 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Msx3P70354 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx3P70354 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx3P70354 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx3P70354 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx3P70354 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx3P70354 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx3P70354 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Msx3P70354 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms