Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgif1P70284 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif1P70284 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms