Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta1P68134 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acta1P68134 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acta1P68134 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acta1P68134 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acta1P68134 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms