Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms