Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabrb3P63080 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms