Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ap1s1P61967 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms