Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5r1P61809 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r1P61809 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r1P61809 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r1P61809 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r1P61809 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r1P61809 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r1P61809 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r1P61809 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r1P61809 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r1P61809 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r1P61809 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r1P61809 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5r1P61809 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms