Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga11P61622 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga11P61622 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga11P61622 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga11P61622 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga11P61622 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga11P61622 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga11P61622 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga11P61622 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms