Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem258P61166 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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