Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tpm2P58774 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm2P58774 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms