Protein–RNA interactions for Protein: P58391

Kcnn3, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn3P58391 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnn3P58391 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms