Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms