Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133 ms