Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckbrP56481 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms