Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AgrpP56473 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AgrpP56473 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AgrpP56473 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms