Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab4aP56371 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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