Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApodP51910 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApodP51910 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ApodP51910 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApodP51910 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApodP51910 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApodP51910 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApodP51910 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApodP51910 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApodP51910 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApodP51910 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApodP51910 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApodP51910 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApodP51910 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApodP51910 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApodP51910 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApodP51910 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApodP51910 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApodP51910 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApodP51910 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApodP51910 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApodP51910 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApodP51910 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApodP51910 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApodP51910 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ApodP51910 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ApodP51910 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ApodP51910 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ApodP51910 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ApodP51910 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ApodP51910 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApodP51910 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApodP51910 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApodP51910 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApodP51910 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApodP51910 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ApodP51910 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApodP51910 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ApodP51910 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApodP51910 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApodP51910 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApodP51910 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ApodP51910 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ApodP51910 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApodP51910 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApodP51910 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApodP51910 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApodP51910 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApodP51910 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApodP51910 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApodP51910 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApodP51910 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApodP51910 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms