Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc3P49135 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms