Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl5P47962 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms