Protein–RNA interactions for Protein: P46978

Stt3a, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3aP46978 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stt3aP46978 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stt3aP46978 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stt3aP46978 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stt3aP46978 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stt3aP46978 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Stt3aP46978 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stt3aP46978 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms