Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnfsf4P43488 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf4P43488 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms