Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgavP43406 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgavP43406 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgavP43406 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgavP43406 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgavP43406 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgavP43406 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgavP43406 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgavP43406 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms