Protein–RNA interactions for Protein: P43241

Cdx2, Homeobox protein CDX-2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx2P43241 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdx2P43241 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms