Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NodalP43021 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NodalP43021 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NodalP43021 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NodalP43021 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NodalP43021 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NodalP43021 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NodalP43021 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NodalP43021 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NodalP43021 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NodalP43021 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NodalP43021 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NodalP43021 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NodalP43021 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NodalP43021 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NodalP43021 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NodalP43021 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NodalP43021 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NodalP43021 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NodalP43021 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NodalP43021 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NodalP43021 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NodalP43021 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NodalP43021 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NodalP43021 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NodalP43021 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NodalP43021 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NodalP43021 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NodalP43021 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NodalP43021 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NodalP43021 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NodalP43021 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NodalP43021 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NodalP43021 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NodalP43021 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NodalP43021 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NodalP43021 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NodalP43021 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NodalP43021 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NodalP43021 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NodalP43021 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NodalP43021 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms