Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms