Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox7P40646 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox7P40646 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox7P40646 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox7P40646 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox7P40646 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox7P40646 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox7P40646 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sox7P40646 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sox7P40646 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox7P40646 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox7P40646 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox7P40646 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox7P40646 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox7P40646 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox7P40646 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox7P40646 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox7P40646 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox7P40646 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox7P40646 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox7P40646 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox7P40646 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox7P40646 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox7P40646 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox7P40646 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox7P40646 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox7P40646 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox7P40646 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox7P40646 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox7P40646 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox7P40646 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox7P40646 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox7P40646 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox7P40646 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sox7P40646 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox7P40646 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox7P40646 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox7P40646 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox7P40646 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox7P40646 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms