Protein–RNA interactions for Protein: P36993

Ppm1b, Protein phosphatase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1bP36993 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppm1bP36993 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppm1bP36993 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms