Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn11P35235 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn11P35235 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms