Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnd1P30999 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd1P30999 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms