Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccnd3P30282 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnd3P30282 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnd3P30282 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnd3P30282 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnd3P30282 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnd3P30282 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnd3P30282 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnd3P30282 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnd3P30282 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnd3P30282 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnd3P30282 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnd3P30282 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnd3P30282 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnd3P30282 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnd3P30282 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnd3P30282 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnd3P30282 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnd3P30282 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnd3P30282 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnd3P30282 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnd3P30282 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnd3P30282 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnd3P30282 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms