Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxraP28700 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxraP28700 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxraP28700 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RxraP28700 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxraP28700 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxraP28700 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxraP28700 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxraP28700 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxraP28700 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxraP28700 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RxraP28700 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxraP28700 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxraP28700 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RxraP28700 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxraP28700 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RxraP28700 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxraP28700 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxraP28700 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxraP28700 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxraP28700 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxraP28700 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxraP28700 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxraP28700 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxraP28700 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxraP28700 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxraP28700 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxraP28700 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxraP28700 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxraP28700 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxraP28700 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxraP28700 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxraP28700 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxraP28700 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RxraP28700 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxraP28700 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RxraP28700 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxraP28700 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxraP28700 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxraP28700 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxraP28700 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxraP28700 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxraP28700 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RxraP28700 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxraP28700 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxraP28700 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxraP28700 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxraP28700 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxraP28700 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxraP28700 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxraP28700 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxraP28700 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxraP28700 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxraP28700 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxraP28700 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxraP28700 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RxraP28700 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RxraP28700 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RxraP28700 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RxraP28700 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxraP28700 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxraP28700 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxraP28700 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxraP28700 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxraP28700 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxraP28700 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxraP28700 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxraP28700 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxraP28700 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxraP28700 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxraP28700 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxraP28700 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxraP28700 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxraP28700 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxraP28700 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxraP28700 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxraP28700 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxraP28700 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxraP28700 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxraP28700 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxraP28700 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxraP28700 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxraP28700 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxraP28700 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxraP28700 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxraP28700 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxraP28700 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxraP28700 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxraP28700 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RxraP28700 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxraP28700 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxraP28700 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxraP28700 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxraP28700 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxraP28700 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxraP28700 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxraP28700 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxraP28700 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxraP28700 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxraP28700 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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