Protein–RNA interactions for Protein: P28659

Celf1, CUGBP Elav-like family member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf1P28659 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Celf1P28659 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Celf1P28659 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Celf1P28659 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Celf1P28659 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Celf1P28659 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms