Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa5P28312 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa5P28312 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa5P28312 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa5P28312 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa5P28312 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa5P28312 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa5P28312 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa5P28312 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa5P28312 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa5P28312 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa5P28312 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa5P28312 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa5P28312 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa5P28312 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa5P28312 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms