Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb1P28230 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms