Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms