Protein–RNA interactions for Protein: P23506

Pcmt1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmt1P23506 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmt1P23506 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms