Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eif3aP23116 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif3aP23116 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms