Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk1P22518 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk1P22518 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk1P22518 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk1P22518 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clk1P22518 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clk1P22518 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms